该中心已经获得了为期5年，价值2000万美元的来自美国国家科学基金会（NSF）的资助以兴建其超级计算机，其将命名为"Gordon"。
该超级计算机将采用高性能的基于闪存的存储器，来代替繁重的硬盘存储系统。在该项目的时间表上提供有未来拓展到固态硬盘（SSD）技术的条目。
这一超级计算机由高性能计算供应商Appro提供，将包括32个"超级节点"，每个超级节点将包括32个计算节点，每计算节点提供240的gigaflop和64 gigabyte的DRAM。每个超级节点还具有两个I/O节点，每个拥有4TB的闪存。当同虚拟共享内存捆绑时，每个超级节点有7.7 teraflop（TF）的计算能力和10 TB的存储（2TB的DRAM和8TB的闪存）。
当完全配置和部署时，Gordon将拥有245 teraflop的总计算能力，64TB DRAM，256TB的闪存和4 petabyte存储。Gordon的32个超级节点将通过InfiniBand连接，达到每秒16 gigabit的双向千兆带宽的能力。其上所采用的集群软件将是ScaleMP的模型化虚拟内存共享软件。
Gordon将被重新设置，以达到每超级节点超过1:1的可寻址内存比例。圣地亚哥超级计算机中心表示，对于许多高性能计算系统，这一比例低于1:10。
