Schrodinger薛定谔分子动力模拟与建模工作站推荐2022v2
配置方案日期：2022年5月3日
Schrodinger是计算化学领域为生命科学和材料研究提供解决方案领先者，是世界一流的分子建模、药物设计和材料科学软件集合，由AutoQSAR，Demond，FEP+、Maesrto 、MS Combi、MS Jaguar、Bioluminate、KNIME Extensions、Canvas、Glide、WaterMap等软件组合而成.其中：
- 药物发现：包含从头设计、虚拟筛选、等级顺序化合物、结构细化和准备、可视化和工作流程、生物制剂建模等，
- 材料科学：原子级仿真可以帮助您在开始合成和测试之前确定最有前途的结构和成分，从而可以加快新材料的开发。从有机电子产品到特种化学品再到聚合物制造
Schrodinger Desmond高性能分子动力学模拟
Desmond结合了速度和准确性，可以进行长时间的分子动力学模拟，从而使用户可以检查具有重要生物学和药学意义的事件。Desmond与Maestro无缝集成，可提供全面的设置，仿真和分析工具，支持GPU加速
FEP +用于药物发现的高性能自由能计算FEP +结合了非常精确的力场（OPLS3e）和改进的采样算法，这些采样算法利用GPU的高性能提供了前所未有的精度来提供结合自由能，为启用结构的药物发现项目提供了重要价值。
DeepChem是一个python库，可提供高质量的开源工具链，用于在药物发现，材料科学，量子化学和生物学方面进行深度学习
Schrodinger软件系统与硬件配置要求
（1）高性能分子动力模拟超算GPU卡要求
A1 服务器级可选：Tesla 系列（A100 80GB、A100 40GB）
A2工作站级可选：RTX A6000 48GB、RTX A5000 24GB、RTXA4000 16GB
GPU卡技术参数：
型号 CUDA核数 显存(MB) 浮点计算指标 TFLOPs (单精度) 显存带宽 (GBs) 备注 Tesla A100 6912 40/80GB HBM2 19 1536 RTX A6000 10752 48GB 40 768 支持3D显示 RTX A5000 8192 24GB 27.77 768 支持3D显示 RTX A4000 6144 16GB 19.17 640 支持3D显示 RTX 5000 3072 16GB 11.15 448 支持3D显示
（2）分子建模与可视化分析配置要求
显示设备：nvidia 3D Vision（四缓冲、OpenGL硬件立体显示）、Zalman 3D 显示器，100Hz刷新率
图形APP:支持OpenGL2.1或更高
（3）支持操作系统
RedHat企业版（RHEL） 6.8-6.10 7.4-7.6
Centos 6.8-6.10 7.4-7.6
Ubuntu 16.04 LTS 18.04 LTS
SUSE SLES/SLED 15, SLES/SLED 12SP4
（4）支持GPU加速的Schrodinger软件包
Desmond MD---高性能分子动力模拟
FEP+ ---用于药物发现高性能自由能计算
WaterMAP ---配体优化的新范式
GPU Shape ---形状筛分（快速高效的基于形状的叠加和相似度搜索工具）
AutoQSAR/DeepChem ---适用于大数据应用的可扩展，直观，深度学习的QSAR模型
Schrodinger（薛定谔）分子动力模拟与建模图形工作站硬件配置推荐2022v2
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NO |
品牌与型号 |
配置规格 |
价格 |
备注 |
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1 |
超频图形工作站 A310 15064-MAC |
Intel 12代超频处理器（16核，其中8核@5.0GHz，8核4.2GHz) / 64GB DDR4 / RTX A4000 16GB/1TB SSD系统盘 +4TB SATA企业级/塔式(1000w)/ 27寸-4K图显 |
37500 |
MD计算，分子建模 |
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2 |
超频图形工作站 AX410 142128-MAC |
intel 至尊超频处理器（18核@4.2GHz） / 96GB DDR4 /RTX 5000 16GB /1TB SSD系统盘 +8TB SATA企业级/塔式(1000w)/ 27寸-4K图显 |
55000 |
MD计算，分子建模 |
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3 |
高频图形工作站 AX420 139128-MB2D |
intel Xeon银牌4316处理器（20核@3.9GHz / 128GB DDR4 /2*RTX A5000 24GB /2TB SSD系统盘 +8TB SATA企业级/塔式(1000w)/ 27寸-4K图显 |
86000 |
MD计算，分子建模 |
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4 |
欧拉图形工作站EX650i 237192-PBD |
2颗Xeon 银牌4314处理器（32核@3.7GHz ）/ 192GB DDR4 / RTX A5000 24GB /2TB SSD系统盘 +8TB SATA企业级/塔式(1300w)/ 27寸-4K图显 |
71000 |
MD计算 |
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5 |
欧拉图形工作站EX650i 239256-PBD |
2颗Xeon 银牌4316处理器（40核@3.9GHz ）/ 256GB DDR4 /RTX A5000 24GB /2TB SSD系统盘 +16TB SATA企业级/塔式(1300w)/ 27寸-4K图显 |
83000 |
MD计算 |
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6 |
欧拉图形工作站EX650i 226512-PCE |
2颗Xeon 金6338处理器（64核@2.6GHz ）/ 512GB DDR4 /RTX A6000 48GB/3.84TB SSD系统盘 +16TB SATA企业级/塔式(1300w)/27寸-4K图显 |
149990 |
MD计算 |
| 7 | 超级图形工作站Alpha750 433384-PBC |
4颗Xeon 金5320H处理器（80核@3.3GHz ）/ 384GB DDR4 /RTX A4000 16GB/960GB SSD/2TB PCIeSSD/16TB SATA企业级/双塔式(2000w)/27寸-4K图显 |
169990 | 多任务计算 |
| 8 |
超级图形工作站Alpha730 443768-PBD |
4颗Xeon 金6256处理器（48核@4.3GHz ）/ 768GB DDR4 /RTX A5000 16GB/960GB SSD/2TB PCIeSSD/2*18TB SATA企业级/双塔式(2000w)/27寸-4K图显 |
279990 | 完美极速计算 |
| 9 | 超级图形工作站Alpha750 437768-PCD |
4颗Xeon 金8360H处理器（96核@3.7GHz ）/ 768GB DDR4 /RTX A6000 48GB/960GB SSD/3.84TB PCIeSSD/2*16TB SATA企业级/双塔式(2000w)/27寸-4K图显 |
350000 | 多任务超级计算 |
UltraLAB工作站针对Schrodinger Desmond（分子动力模拟） GPU并行计算配备最新图卡或计算卡，同时整机系统的优化，MD仿真的运行速度比CPU快200倍，另外UltraLAB极速工作站配备最新nvidia 图灵架构专业图卡，加速复杂的立体是分子建模与分析。
上述所有配置，代表最新硬件架构，同时保证是最完美，最快，如有不符，可直接退货
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UltraLAB图形工作站供货商：
西安坤隆计算机科技有限公司
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